《中国药典》（年版）收载有“木香”之名的药物只有三种，即木香、川木香和土木香。虽言“木”香，来源却非木本，而是来源于菊科草本植物的根。从药材质地而言，三者中只有川木香质硬脆、易折断，余者质坚硬、不易折断。从功效而言，三者皆有行气止痛之效，然木香另有健脾消食之功，土木香兼有健脾和胃、安胎之效。
从历代应用和市场流通品种看，还有其他有“木香”之名的中药，如广木香、云木香、青木香、祁木香、红木香等，以下逐一分说。
木香、广木香、云木香本一物。木香原主产于印度、缅甸、巴基斯坦等国，以自广州进口、形如枯骨的质量最好，故有广木香之称。《四声本草》也说木香“昆仑船上来，形如枯骨者良”，《本草图经》则言“今惟广州舶上有来者也，他无所出”。后我国大量引种，已有数十年的历史，尤以云南丽江地区和迪庆州产量最大、质量佳，故又有云木香之名。现临床处方用药时，多用广木香或云木香之名强调优质饮片入药。
木香，来源于菊科多年生高大草本木香的根，又有名青木香（《本草经集注》）、南木香（《世医得效方》）等。药材气香特异，味微苦。木香本名蜜香，因香气如蜜，后讹传为木香。《本草纲目》载言：“木香，草类也。本名蜜香，因其香气如蜜也。缘沉香中有蜜香，遂讹此为木香尔。”木香始载于《神农本草经》，列为上品，言“主邪气，辟毒疫温鬼，强志，主淋露。久服不梦寤魇寐”。木香辛散苦泄温通，芳香醒脾，有行气止痛、健脾消食的功效，临床常用于胸胁、脘腹胀痛、泻痢后重、食积不消、不思饮食。木香生用行气力强，煨用行气力缓而多用于止泻。《太平惠民和剂局方》木香汤，与青皮、姜黄、莪术、炒麦芽等同用，治食积气滞、胸膈痞塞、心腹刺痛、胁肋胀满、饮食减少、噫气吞酸、呕逆噎闷者。《太平圣惠方》木香丸，配当归、川芎、黄芩、桔梗等药，治小儿冷热不调、腹痛不可忍，或时寒热、下痢脓血者。《中国医学大辞典》香砂六君子丸，常与党参、白术、茯苓、砂仁、陈皮、半夏、枳实等药同用，治脾胃气虚、运化无力、脘腹胀满、呕恶食少、消化不良等症。因木香辛温香燥，易伤阴血，故阴虚、津亏、火旺者慎服。
质脆易折川木香。川木香，来源于菊科多年生草本植物川木香或灰毛川木香的根。因主产于四川省阿坝藏族羌族自治州及雅安等地而得名。气微香，味苦，嚼之粘牙。药材外皮脱落可见丝瓜络状细筋脉，根头偶有“油头”。呈圆柱形，习称“铁杆木香”，或成纵槽半圆柱形，习称“槽子木香”。川木香仅有行气止痛的功效，临床常用于胸胁、脘腹胀痛、肠鸣腹泻、里急后重。
祁木香亦为土木香。土木香为菊科植物土木香的根。气微香，味苦、辛。主产于河北，有祁木香之称（《河北药材》）。《蜀本草》中记载后蜀国主孟昶苑中曾种的“木香”，《本草图经》考证后认为“恐亦是土木香种也”。另有《本草衍义》中所称塞外所得青木香，亦为土木香。土木香有健脾和胃、行气止痛、安胎的功效。临床用于胸胁、脘腹胀痛、呕吐泻痢、胸胁挫伤、岔气作痛、胎动不安。《湖北中草药志》有用土木香治牙痛的记载，直接捣烂或嚼烂，含患处或入虫牙孔内即可。值得注意的是，血虚内热者要慎服。
古今青木香莫混用。今之青木香为藤本植物马兜铃或北马兜铃的根，而古之青木香乃木香的别名。《新修本草》中将马兜铃根称作土青木香，便是对木香的别称青木香而言。《本草纲目》明确记载木香“昔人谓之青木香，后人因呼马兜铃根为青木香，乃呼此为南木香、广木香以别之”。《本草蒙筌》将土青木香简作青木香，今通行之。因此在按古方用青木香时务必注意，切莫用错品种。如从苏合香丸拆方研究冠心苏合丸时，用的便该是菊科植物青木香而非马兜铃根青木香。马兜铃根青木香含有马兜铃酸，可引起肾脏损害等不良反应，不可用于中成药，饮片配方也应慎用，不宜久服。国家药品标准处方中含有青木香的中成药品种早在年9月30日前已将处方中的青木香替换为了土木香。《中国药典》年版及之后也已将该品种删除。目前仅有《广西中药饮片炮制规范》（年版）有收载该品种，言其有平肝止痛、解毒消肿的功效，用于眩晕头痛、胸腹胀痛、痈肿疔疮、蛇虫咬伤。
南五味子红木香。红木香为五味子科常绿木质藤本长梗南五味子的根或根皮入药，味辛性温，有理气止痛、祛风通络、活血消肿的功效。红木香始载于《本草纲目拾遗》，言“治风气痛，伤力，跌扑损伤，胃气疼痛，食积，痧胀等症，俱酒煎服”，主治气滞脘腹胀痛、筋骨疼痛、痛经、跌打损伤、无名肿毒等证，民间多用。红木香虽未被药典收录，却也被多省中药饮片炮制规范收录，如《安徽省中药饮片炮制规范》（第三版）（年版）记载红木香来源于南五味子的根或根皮，且言临床处方写红木香、紫金皮均付红木香。有《疡科选粹》一紫散，用紫金皮、生地黄治伤损眼胞，青黑紫色肿痛。
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